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本文介紹伴刀豆球蛋白A,及其與磁珠共價(jià)偶聯(lián)后的ConA磁珠的應(yīng)用場(chǎng)景。
伴刀豆球蛋白A磁珠 (Concanavalin A-Coated Magnetic Beads,簡(jiǎn)稱(chēng)ConA磁珠),顧名思義,就是植物凝集素伴刀豆球蛋白A(ConA)和超順磁性納米材料進(jìn)行偶聯(lián)的一種生物磁珠。下面將逐一介紹有關(guān)ConA磁珠的那些事兒。
伴刀豆蛋白A
伴刀豆球蛋白A(Concanavalin A, ConA),是自1936年以來(lái),第一個(gè)從刀豆(Canavalia ensiformis,洋刀豆)分離純化結(jié)晶的一種植物凝集素蛋白,無(wú)血型特異性。
ConA根據(jù)所處溶液pH值的不同,主要有2種形式:α-2 同源二聚體或 α-4 同源四聚體[2]。堿性條件下(pH>7.0)以四聚體(四個(gè)分子量為26kDa亞基構(gòu)成)形式存在;酸性條件(pH 4.5-5.5)下,Con A解離為活化的二聚體結(jié)構(gòu)(52kDa)。除此之外,ConA的功能受二價(jià)陽(yáng)離子的影響,如在缺乏金屬離子(Ca2+ 和 Mn2+ )的情況下,其構(gòu)象、糖蛋白結(jié)合功能是無(wú)法得到發(fā)揮[1]。
圖1.ConA分子模型(A) ConA monomer, (B) ConA dimer, (C) ConA tetramer with mannose, glucose and metal ions
磁 珠
生物磁珠是一類(lèi)具有納米粒徑大小,由高分子聚合物和無(wú)機(jī)磁性納米粒子形成的磁性微球。磁珠按照其結(jié)構(gòu)可以分為三大類(lèi):核-殼型結(jié)構(gòu)、夾層式結(jié)構(gòu)、彌散型結(jié)構(gòu)。磁性物質(zhì)有純鐵粉、羰基鐵、磁性礦、正鐵酸鹽、鐵鈷合金等。
磁性納米材料,因其具備特殊的效應(yīng),如小尺寸效應(yīng)、表面效應(yīng)和量子尺寸效應(yīng)等,在Fe3O4 納米顆粒的尺寸小于30 nm時(shí), 納米顆粒內(nèi)部熱騷動(dòng)的干擾表現(xiàn)顯著, 此時(shí), 這類(lèi)納米顆粒就表現(xiàn)出一種特殊的磁學(xué)性質(zhì), 即超順磁性。超順磁性Fe3O4 納米顆粒具備優(yōu)質(zhì)的屬性,如無(wú)毒、良好的生物相容性、獨(dú)特的磁靶向特性以及在交變磁場(chǎng)中易于產(chǎn)熱等性質(zhì), 在生物行業(yè)中得到廣泛應(yīng)用。
而將ConA與微球進(jìn)行共價(jià)偶聯(lián)用于固定生物分子,則有以下優(yōu)勢(shì):
1. 共價(jià)偶聯(lián)結(jié)合穩(wěn)定性高,便于重復(fù);
2.配體ConA結(jié)合在微珠表面,可用于靶分子相互作用;
3.溶液環(huán)境的動(dòng)力學(xué)特征,適合生物學(xué)實(shí)驗(yàn)操作。
ConA磁珠的應(yīng)用
根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo),ConA磁珠的主要應(yīng)用分為3種場(chǎng)景,分別是進(jìn)行細(xì)胞質(zhì)膜分離、糖蛋白富集、和分離固定細(xì)胞方面。
利用ConA磁珠受二價(jià)陽(yáng)離子的激活影響,使其存在于Ca2?和Mg2?溶液環(huán)境中,其具備的末端α-D-甘露糖基和α-D-葡萄糖基的親和作用功能,用在質(zhì)膜純化方面,是一種簡(jiǎn)便、高效的方式。如細(xì)胞或組織的質(zhì)膜分離,是進(jìn)一步獲取質(zhì)膜蛋白的關(guān)鍵步驟。而ConA是能結(jié)合細(xì)胞上糖基化蛋白,可利用此原理,獲取純度更高的質(zhì)膜。主要操作步驟為:通過(guò)將生物素化的ConA與鏈霉親和素磁珠結(jié)合,將ConA固定在磁珠上;細(xì)胞膜與ConA磁珠孵育1h;磁力架上吸附;TBS洗滌5次;洗脫液洗脫細(xì)胞質(zhì)膜溶液[3]。
圖2. ConA磁珠純化質(zhì)膜步驟
ConA對(duì)甘露糖(mannose)和葡萄糖(glucose)具有特異性,且ConA識(shí)別α-連接甘露糖,這種甘露糖恰好是許多血清和細(xì)胞膜糖蛋白的“核心寡糖"。因此可用在免疫學(xué)等方面的分離細(xì)胞或組織裂解液或血清中的糖蛋白等糖基化分子。
主要操作步驟為:通過(guò)雙功能連接劑亞油酸雙- N-羥基琥珀酰亞胺酯 (DSS) 將氨基硅烷化的磁性納米微珠( MNPs) 與ConA進(jìn)行交聯(lián),獲取ConA磁珠;使用甲氧基乙二醇(MEG)終止磁性納米微球的非特異性結(jié)合,進(jìn)行磁分離;將加入用胰蛋白酶消化的細(xì)胞膜蛋白提取液,與ConA磁珠兩者孵育,磁力架收集已結(jié)合糖蛋白的ConA磁珠,洗滌非糖肽,最后洗脫捕獲的糖肽,進(jìn)行真空干燥。通過(guò)該方法,可以對(duì)腫瘤相關(guān)蛋白 (如EGFR) 的特定糖基化位點(diǎn)進(jìn)行深入分析[4]。
圖3. 超順磁性納米顆粒偶聯(lián)不同凝集素
利用ConA磁珠(磁珠與高純度的伴刀豆球蛋白A共價(jià)結(jié)合)與細(xì)胞膜或核膜上的糖蛋白結(jié)合,從而捕獲細(xì)胞或細(xì)胞核,可實(shí)現(xiàn)少量細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)操作可視化。如ConA磁珠用于用于研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的新型技術(shù)的CUT&Tag和CUT&RUN[5]實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)ConA磁珠與細(xì)胞結(jié)合固定,實(shí)現(xiàn)可視化操作,避免離心帶來(lái)的細(xì)胞丟失問(wèn)題。
相對(duì)傳統(tǒng)研究DNA與蛋白互作的ChIP-seq技術(shù),CUT&Tag和CUT&RUN具備以下優(yōu)勢(shì):
ConA磁珠與細(xì)胞膜糖蛋白結(jié)合,可視化操作,提升實(shí)驗(yàn)操作體驗(yàn)感;
無(wú)需離心,只需要ConA磁珠吸附在磁力架上,即可完成細(xì)胞樣本和溶液的分離;
可低至10個(gè)細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)操作,規(guī)避ChIP-seq的大量樣本的需求。
圖4. ChIP-seq,CUT&Tag,CUT RUN實(shí)驗(yàn)流程示意圖
翌圣ConA磁珠
翌圣自研ConA磁珠,經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的原料篩選、多重工藝的優(yōu)化和改善,能夠快速、高效、靈敏、特異性地與糖蛋白、糖脂、多糖等帶有糖基化修飾分子結(jié)合。主要用于分離細(xì)胞或用于分離細(xì)胞或組織裂解液或血清中的糖蛋白等糖基化修飾分子等實(shí)驗(yàn),特別直接用于CUT &RUN和CUT&Tag(ChIP-seq實(shí)驗(yàn)的革新性技術(shù))等實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品特點(diǎn)
細(xì)胞捕獲效率>90%;
穩(wěn)定的批次生產(chǎn)和較好的結(jié)果重復(fù)性;
性能存放穩(wěn)定。
產(chǎn)品信息
貨號(hào) | Cat#19810ES |
規(guī)格 | 1mL/5mL/20mL |
顏色 | 棕黃色 |
磁珠濃度 | 10 mg/mL |
固含量 | 9-11 mg/mL |
磁珠尺寸大小 | 1 µm |
載量 | 105個(gè)細(xì)胞/μL磁珠 |
細(xì)胞捕獲 | 細(xì)胞捕獲率>90% |
產(chǎn)品性能數(shù)據(jù)
單分散性
分別取競(jìng)品和翌圣ConA磁珠以及翌圣裸球原料各10µL,相同處理?xiàng)l件下,放大倍數(shù)10×/40×鏡下,翌圣ConA磁珠基本呈單分散性,相對(duì)競(jìng)品,未見(jiàn)明顯團(tuán)聚。
ConA結(jié)合細(xì)胞效果
相同數(shù)量細(xì)胞與磁珠結(jié)合孵育相同時(shí)間,細(xì)胞分析儀下自動(dòng)檢測(cè)ConA磁珠結(jié)合后剩余細(xì)胞數(shù)量,結(jié)果顯示翌圣ConA磁珠(Cat#19810)優(yōu)于競(jìng)品。
10µL翌圣ConA磁珠(Cat#19810)和10µL競(jìng)品ConA磁珠,都可結(jié)合E7級(jí)別數(shù)量的細(xì)胞,與競(jìng)品相當(dāng)。重復(fù)操作下,細(xì)胞捕獲率>90%。
加速穩(wěn)定性
按1 mL/管進(jìn)行分裝。儲(chǔ)存條件分別為:4℃,37℃加速處理2天、4天、7天、11天和14天,-20℃破壞處理1天、3天、6天和8天。結(jié)果顯示同等實(shí)驗(yàn)條件下:4℃保存產(chǎn)品、37℃加速處理和-20℃破壞處理的產(chǎn)品細(xì)胞捕獲率>95%,各處理?xiàng)l件下,3組重復(fù)CV值在1%以內(nèi),重復(fù)性良好。
歡迎大家根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需要咨詢、選購(gòu)!
產(chǎn)品訂購(gòu)指南
產(chǎn)品名稱(chēng) | 產(chǎn)品編號(hào) | |
CUT&Tag組合套裝 | Hieff NGS® In-Situ DNA Binding Profiling Library Prep Kit for Illumina® V2 | 12597ES |
InStab™ Protease Cocktail,EDTA-free,mini,tablet-form 蛋白酶抑制劑Cocktail,EDTA-free,迷你型,片劑 | 20123ES | |
Goat Anti-Mosue lgG(H+L) 山羊抗鼠IgG | 34851ES | |
Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina® | 12416ES | |
CUT&Tag單品 | pA-Tn5 Transposase (10 U/μL) | 14528ES |
pA-Tn5 Transposase (10 U/μL, without buffer) | 14529ES | |
pG-Tn5 Transposase (10 U/μL) | 14530ES | |
Nanobody-Tn5(anti-mouse & anti-rabbit) | 12595ES | |
Anti-rabbit Tn5 | 12594ES | |
Concanavalin A-Coated Magnetic Beads | 19810ES |
參考文獻(xiàn):
[1].R A Bryce, I H Hillier, J H Naismith, Carbohydrate-protein recognition: molecular dynamics simulations and free energy analysis of oligosaccharide binding to concanavalin A. Biophys J. 81 (Sept. 2001): 1373-88. Abstract. PubMed. Web. 3 Sept. 2010.
[2].Chun-Yang Li, Huai-Long Xu, Bo Liu, Jin-Ku Bao, Concanavalin A, from an Old Protein to Novel Candidate Anti-Neoplastic Drug, Curr Mol Pharmacol. 2010 Nov;3(3):123-8.
[3].Yu-Chen Lee 1, Gregory Block, Huiwen Chen, et al, One-step isolation of plasma membrane proteins using magnetic beads with immobilized concanavalin A, Protein Expr Purif. 2008 Dec;62(2):223-9.
[4].Juanilita T Waniwan, Yi-Ju Chen, Rey Capangpangan, Glycoproteomic Alterations in Drug-resistant Non-small Cell Lung Cancer Cells Revealed by Lectin Magnetic Nanoprobe-based Mass Spectrometry, J Proteome Res. 2018 Nov 2;17(11):3761-3773.
[5].Hatice S Kaya-Okur, Derek H Janssens, Steven Henikoff, Efficient low-cost chromatin profiling with CUT&Tag, Nat Protoc. 2020 Oct;15(10):3264-3283.