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甜菜堿 Betaine ——高性能的PCR增強(qiáng)劑

2017-5-2  閱讀(1033)

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    為提高含高GC含量或連續(xù)多個(gè)A/T的復(fù)雜基因的PCR擴(kuò)增效率及擴(kuò)增特異性,科研人員通常會(huì)嘗試在PCR反應(yīng)體系中添加增效劑。翊圣生物現(xiàn)為廣大科研人員提供質(zhì)量高、適用性廣的兩種PCR增效劑:甜菜堿與海藻糖。

 

甜菜堿

 

    甜菜堿是一種從甜菜中發(fā)現(xiàn)的生物堿,是膽堿氧化代謝的終產(chǎn)物,參與甲硫氨酸(蛋氨酸)生物合成路徑,是非常重要的滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)。翊圣生物提供的甜菜堿有兩類,鹽酸甜菜堿和甜菜堿水合物,后者分子式為C5H11NO2 H2O是分子生物學(xué)級(jí)別,純度(TLC)≥99%,可用于分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。

 

產(chǎn)品介紹

 

    翊圣生物是在工具酶及其反應(yīng)輔助試劑方面經(jīng)驗(yàn),確保*高品質(zhì)甜菜堿,并大量現(xiàn)貨,可保證批次間產(chǎn)品的穩(wěn)定性。該產(chǎn)品可作為原料用于PCR、RT-PCR、qPCR等實(shí)驗(yàn)反應(yīng)優(yōu)化的添加劑成分,大大改善擴(kuò)增效率和擴(kuò)增特異性、改善逆轉(zhuǎn)錄效率等。

 

甜菜堿特點(diǎn)

 

1. 甜菜堿可幫助DNA聚合酶順利通過(guò)DNA某些復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu),防止DNA聚合酶的從模板DNA中解離。

DNA局部區(qū)域因含有多個(gè)復(fù)雜堿基(Py-G-C),會(huì)促使DNA聚合酶的停滯,zui終導(dǎo)致DNA聚合酶停止有效延伸。而甜菜堿可提高DNA小溝中富含鳥嘌呤和胞嘧啶區(qū)域的鳥嘌呤和胞嘧啶的水合作用,影響DNA分子結(jié)構(gòu),改變DNA靈活性,幫助DNA聚合酶沿著DNA模板延伸[1]。

2. 甜菜堿可消除變性溫度對(duì)堿基的依賴性。濃度依賴性降低高GC含量序列的Tm,并使PCR兩引物的Tm相接近,zui終降低DNA Tm[2]。

3. 高濃度的甜菜堿溶液可穩(wěn)定DNA-蛋白復(fù)合物。

4. 在逆轉(zhuǎn)錄溫度條件下,甜菜堿可減少RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的形成。在甜菜堿和海藻糖聯(lián)合用于逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)時(shí),甜菜堿減少RNA分子內(nèi)復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)的形成,降低RNA溶解溫度;海藻糖穩(wěn)定逆轉(zhuǎn)錄酶,保持逆轉(zhuǎn)錄酶活性。通過(guò)二者聯(lián)合,確保更長(zhǎng)cDNA的合成長(zhǎng)度[3]。

 

主要應(yīng)用

 

1. 可應(yīng)用于DNA的測(cè)序反應(yīng)實(shí)驗(yàn)中,提升含有重復(fù)序列(連續(xù)多個(gè)AT)的測(cè)序性。

2. 提升長(zhǎng)片段DNAPCR成功率。

3. 適用于復(fù)雜模板的PCR擴(kuò)增,如高GC含量DNAPCR擴(kuò)增。

4. 適用于某些粗糙模板的直接測(cè)序,如經(jīng)NaOH溶液裂解的細(xì)胞裂解物。

5. 適用于較長(zhǎng)cDNA的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。

6. 作為LAMP環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增的添加劑。

 

甜菜堿參數(shù)

 

中文別名(Chinese Synonym

甜菜堿一水合物,一水甜菜堿,*基甘氨酸一水合物

英文別名(English Synonym

Betaine monohydrate;(Carboxymethyl) trimethylammonium hydroxide monohydrate

CAS號(hào)(CAS NO.

590-47-6

分子式(Formula

C5H11NO2 H2O

分子量(Molecular Weight

135.16g/mol

外觀(Appearance

晶體粉末

純度(Purity

99%

溶解性(Solubility

溶于水,可配置成10%水溶液

結(jié)構(gòu)式(Structure

 

溶液配制

 

溶于水。濃度為10%水溶液,質(zhì)量體積比。溶液無(wú)色透明。

 

參考文獻(xiàn)

 

[1]. Myka DS,Chamberlin MJ. Analysis and suppression of DNA polymerase pauses associated with a trinucleotide consensus. Nucleic Acids Res.1996 Jul 15;24(14):2774-81.

[2]. Rees WA,Yager TD,Korte J,von Hippel PH. Betaine can eliminate the base pair composition dependence of DNA melting. Biochemistry.1993 Jan 12;32(1):137-44.

[3]. Spiess AN,Ivell R. A highly efficient method for long-chain cDNA synthesis using trehalose and betaine. Anal Biochem.2002 Feb 15;301(2):168-74.

 

 

 

訂購(gòu)信息

 

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

規(guī)格

價(jià)格(元)

60391ES60

Betaine 甜菜堿(分子生物學(xué)級(jí)別)

100g

286.00

60391ES76

Betaine 甜菜堿(分子生物學(xué)級(jí)別)

500g

956.00

 

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