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29

2012年
12月

對scFv基因文庫及pHEN1噬菌體展示栽體的限制性消化

[方法]1,配制兩個100ulPCR反應(yīng)混合液來消化scFV文庫,其中1個用于VH-VκscFv文庫,另1個用于VH-VλscFv文庫,該混合液含有:●scFVDNA(1~4ug),50ul●水,33ul●10×NEB3緩沖液,10ul●乙酰BSA(100×),1.0ul●Nco工(10U/ul),3.0f11●NoJ工(10U/ul),3.0ul2.37℃孵育反應(yīng)液過夜。要用37℃孵育箱或者有加熱蓋的加熱裝置,防止水分蒸發(fā)?;蛘?,可以按PCR反應(yīng)那樣加一層礦物油(Sigma)。3.用1%瓊脂糖
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27

2012年
12月

電轉(zhuǎn)化連接物構(gòu)建抗體文庫

[方法]1.將電轉(zhuǎn)化儀設(shè)置為200D(電阻)、25rtF(電容)和2.5kV。2.在冰上復溶電感受態(tài)細菌或使用新鮮制備的電感受態(tài)細胞。將電轉(zhuǎn)化杯、杯固定夾、細胞和DNA均放于冰上。3.將80ng已純化且無鹽的DNA與50g1細菌混合。冰上孵育混合物1分鐘。4.將混合物轉(zhuǎn)移至0.2cm間距的電轉(zhuǎn)化杯中,小心操作切勿在電極間留氣泡。輕拍小杯,使所有液體均沉淀于瓶底。迅速轉(zhuǎn)移以使小杯處于低溫狀態(tài)。5.將透明杯放入電轉(zhuǎn)化儀內(nèi),確保小杯側(cè)面干燥(以免電?。?。啟動脈沖,立即加入1.0mlSOC培養(yǎng)基并混合。
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27

2012年
12月

制備用于抗原上選擇的噬菌體抗體

抗體文庫儲存料中制備噬菌體。在開始實驗之前,先用滴定法(在TYE/amp/glu平板上系列稀釋鋪板)計算每毫升抗體文庫儲存料中細菌的數(shù)目。在600nm(A600)處的某個特定吸光值下,抗體文庫中細菌數(shù)目較未感染細菌數(shù)目低一些。這或許是因為含有質(zhì)粒的文庫細菌體積更大,或者是存在死細菌。一旦滴度與A600確定關(guān)系,吸光值即可用于細菌數(shù)目的計算。對于噬菌體的制備(文庫救援),來自文庫儲存料的起始接種量應(yīng)比文庫容量大5倍。接種到培養(yǎng)基后,細菌濃度的A600不應(yīng)超過0.05。采用文庫容量5倍以上的細菌接種
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25

2012年
12月

用氯化銫離心法純化噬菌體

1.在每毫升zui后的噬菌體懸液(例如來自實驗方案13.11)中,加入0.45g氯化銫,充分混勻至溶解。2.用吊桶式轉(zhuǎn)頭(或與其相當?shù)男吞枺╇x心溶液,15℃17h,噬菌體將濃縮在組分1和組分2中(。組分1的濃度較高,但組分2的體積較大。用巴氏滴管或塑料注射器吸取這些組分。如果是*次使用本實驗方案,那么先收集所有條帶并分別對其檢測將是明智之舉。3.將收獲的溶液對PBS透析過夜。4.通過感染大腸桿菌DH5cF,或TGl滴定各個不同組分中噬菌體,并保存滴度zui高的組分。通常,噬菌體會集中在1個區(qū)帶內(nèi)
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25

2012年
12月

從噬菌體文庫選擇抗原特異性抗體

從噬菌體抗體文庫中分離抗原特異性抗體,是通過讓噬菌體進入到在抗原上進行的重復性選擇循環(huán)來實現(xiàn)的。理想情況下,僅需l輪選擇即可完成。但事實是,絲狀噬菌體常常非特異性地結(jié)合到支持物表面,從而限制了每輪所能獲得的富集水平。實際上,需要2~5輪的選擇?,F(xiàn)在已設(shè)計了許多各自不同的選擇方法;其中包括在固相支持物上包被抗原進行生物淘選,使用免疫親和層析注或BIAcore傳感芯片,用生物素化抗原選擇E37J,多肽E383,在固定的原核生物E393或哺乳動物E403細胞、組織培養(yǎng)細胞E41-433、新鮮細胞上進行
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22

2012年
12月

在微量滴定板中進行可溶性SCFv ElISA的方法

1.按每孔100pl蛋白抗原包被微量滴定板,4℃過夜。PBS中10ug/m1的濃度是包被抗原的標準濃度。但有時需要更高的濃度或者不同的包被緩沖液(比如碳酸鹽緩沖液)。2.棄去抗原液并用PBS洗滌板孔2次。3.加入200gl的2%MPBS封閉每個板孔,37℃孵育2小時。4.用PBS洗滌板孔3次。5.每孔加入50ul的4%MPBS。6.每孔加入50ul含可溶性抗體的培養(yǎng)基上清,用移液器反復吹吸混勻,室溫孵育1小時。7.棄去溶液,用PBS/Tween洗滌板孔3次,再用PBS洗滌3次。8.每孔加入100
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22

2012年
12月

噬菌體抗體的親和力成熟

噬菌體展示可使抗體親和力提高到1000倍以上。很典型的起始點是自噬菌體抗體文庫中分離特異性抗體。為完成親和力的成熟(親和力的增加),要對抗體序列進行多樣化;突變基因文庫展示在絲狀噬菌體表面上,并在抗原上選擇具有更高親和力的結(jié)合性抗體。盡管整個過程已相當清晰,但研究者在進行體外親和力成熟前必須明確:提高特定抗體親和力將會產(chǎn)生預(yù)期的生物學效果。當嘗試用抗體中和循環(huán)中的毒素或生長因子時,更高的親和力就顯得特別重要。在此情況下,抗體與抗原都分布于同樣的區(qū)域,能使抗原抗體的相互作用達到平衡狀態(tài)。親和力越高
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20

2012年
12月

利用血清篩選噬菌體文庫

利用含有目標受體的復雜混合物,對噬菌體展示肽文庫進行篩選。這適用于許多令人感興趣的生物體系,如血清、腦脊液及其他生物性體液和細胞或組織表面等。在此情況下,目標就是要鑒定出結(jié)合于特定受體分子或結(jié)合于一組具有特定性質(zhì)的受體上的多肽。我們及他人都在致力于鑒定那些可與疾病特異性相關(guān)的抗體(疾病特異性抗體,DS-Ab)相結(jié)合的多肽。這里我們所描述的方法,是用來鑒定丙型肝炎感染(HCV)特異性相關(guān)抗體的相應(yīng)配體。HCV是一種性慢性肝病的主要病因。利用來自HCV感染者和非感染者的血清(以下分別稱為陽性血清和陰
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