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外泌體研究歷程,你知多少?

2020-9-28  閱讀(1415)

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外泌體研究歷程,你知多少?

外泌體(Exosome)參與細(xì)胞之間的交流,物質(zhì)的運(yùn)輸以及正常生理過(guò)程的維持、還與疾病息息相關(guān),越來(lái)越多的人做這方面的研究。關(guān)于外泌體提取、組成、“載體”和相應(yīng)功能的精///準(zhǔn)分子機(jī)制近些年越來(lái)越受到關(guān)注,而且發(fā)表的有關(guān)外泌體的文章也在逐年增加。外泌體(Exosome)的研究歷程主要包括外泌體提取與純化、外泌體鑒定與檢測(cè)、外泌體熒光標(biāo)記、和外泌體的蛋白組學(xué)以及下游機(jī)制研究等。下面我們就簡(jiǎn)單介紹一下外泌體的研究歷程。

1.什么是外泌體?

外泌體(Exosome)是一種由活細(xì)胞分泌到細(xì)胞外環(huán)境的膜性小囊泡,是細(xì)胞間信息傳遞的重要載體。外泌體天然存在于體液中,參與細(xì)胞間相互作用。

  

2.外泌體組成與功能

外泌體Exosome攜帶大量特異性的蛋白質(zhì)以及功能性的mRNAs、miRNAs等,在體內(nèi)參與細(xì)胞通訊、細(xì)胞遷移、促血管新生和抗腫瘤免疫等生理過(guò)程,與多種疾病的發(fā)生和進(jìn)程密切相關(guān)。不僅可以作為診斷多種疾病的生物指標(biāo),也可以作為治療手段,未來(lái)有可能作為藥物的天然載體用于臨床治療,是液態(tài)活檢領(lǐng)域“三駕馬車(chē)”之一。目前外泌體研究主要集中在外泌體提取、純化、鑒定和分析上。

 

圖1 外泌體組分

 

3.外泌體分離方法

目前已經(jīng)開(kāi)發(fā)出多種外泌體(Exosome)提取方法包括:密度梯度,體積排阻,免疫磁珠和基于聚合物沉淀的方法。根據(jù)外泌體的體積,密度和表面標(biāo)志物的不同進(jìn)行分離,不同提取外泌體方法優(yōu)劣勢(shì)比較如下:

分離方法

分離原理

優(yōu)點(diǎn)

缺點(diǎn)

超速離心法

根據(jù)顆粒的密度,大小,形態(tài)逐級(jí)離心

成本低;容量大; 試劑污染小。

儀器價(jià)格比較高;

操作時(shí)間比較長(zhǎng);

外泌體形態(tài)受損。

超濾法

超濾膜用于從蛋白質(zhì)和其它大分子分離外泌體。外泌體群集中在膜上。

速度快; 不需要特殊儀器; 使用輕便。

壓力會(huì)破壞外泌體;

吸附造成損失;堵塞濾膜。

體積排阻法

體積排阻層析分離基于它們的大小。它使用填充有多孔聚合珠的柱子。

純度高;外泌體形態(tài)和活性較好; 重復(fù)性強(qiáng); 上樣量大

需要精密的儀器;

花費(fèi)較大;

時(shí)間比較長(zhǎng)。

外泌體沉降法

利用外泌體的溶解度或者分散性通過(guò)排水聚合物進(jìn)行沉淀

使用方便;不需要特殊儀器; 可以大量制備。

 

非外泌體物質(zhì)會(huì)發(fā)生共沉淀。 例如蛋白質(zhì),RNA,聚合物原料,需要進(jìn)行樣品的前處理和后處理。

免疫磁珠法

通過(guò)外泌體表面蛋白的抗原抗體相互作用

特異性強(qiáng); 純度較高。

 

試劑價(jià)格昂貴; 適用性比較低; 產(chǎn)量較低; 只針對(duì)沒(méi)有細(xì)胞的樣品。

色譜法

根據(jù)外泌體的大小進(jìn)行分離

得到的外泌體大小均一

設(shè)備特殊,價(jià)格高,應(yīng)用不廣泛

目前翌圣生物公司提供的細(xì)胞上清/血清血漿外泌體提取試劑盒(貨號(hào):41201ES25和41202ES30,采用*的分離技術(shù),可以快速?gòu)募?xì)胞培養(yǎng)上清中獲得大量完整的外泌體顆粒,適用于下游的細(xì)胞共培養(yǎng)、電鏡分析、Western Blot、熒光定量(qPCR)和高通量測(cè)序等應(yīng)用。細(xì)胞上清外泌體抽提試劑實(shí)驗(yàn)流程如下:

 

圖2 細(xì)胞上清外泌體抽提試劑盒實(shí)驗(yàn)流程

 

4.外泌體鑒定

外泌體的功能研究第—步,即進(jìn)行外泌體的鑒定。目前包括電鏡法、NTA粒徑法、WB法、核酸分析法等來(lái)鑒定外泌體的結(jié)構(gòu)、特異性蛋白、核酸序列等。

結(jié)構(gòu)分析--電鏡法

在外泌體研究中,電鏡能夠直接觀察到樣品中外泌體的形態(tài)。并且具有很高的分辨率,能夠鑒別大小不一的外泌體。但對(duì)樣品的預(yù)處理和制備上面要求較高,樣品的準(zhǔn)備階段比較復(fù)雜,不適合對(duì)外泌體進(jìn)行大量快速的測(cè)量。而且由于外泌體經(jīng)過(guò)了預(yù)處理和制備過(guò)程,無(wú)法準(zhǔn)確的進(jìn)行外泌體濃度的測(cè)量。

 

圖2 電鏡分析外泌體形態(tài)結(jié)構(gòu)(圖片來(lái)源:Current protocols in cellbiology(2006): 3-22)

結(jié)構(gòu)分析--NTA技術(shù)

NTA技術(shù)是表征外泌體濃度粒徑測(cè)試手段之一,對(duì)不同大小的外泌體顆粒追蹤和分析,計(jì)算出外泌體的直徑和濃度。相較于其他表征方式,NTA技術(shù)的樣本處理更簡(jiǎn)單、更能保證外泌體原始狀態(tài)、檢測(cè)速度更快。

 

3 NTA分析外泌體顆粒直徑符合標(biāo)準(zhǔn), 顆粒分散性好,大小均一。

蛋白鑒定-WB分析

WB分析典型的標(biāo)記蛋白包括四跨膜蛋白超家族,如CD9、CD63、CD81等,定性鑒定檢測(cè)需要選擇至少2個(gè)指標(biāo)才能達(dá)到文章發(fā)表要求,比如檢測(cè)CD63和TSG101。外泌體鑒定試劑盒(貨號(hào):41203ES05)是翊圣生物針對(duì)外泌體標(biāo)志蛋白CD63和TSG101檢測(cè)而研發(fā)的一款高效且方便的外泌體鑒定試劑盒產(chǎn)品。該抗體經(jīng)過(guò)嚴(yán)格篩選而得,適用于外泌體CD63和TSG101蛋白的檢測(cè)。

該產(chǎn)品適用于人、大鼠、小鼠外泌體的鑒定。

 

圖4 P為CD63&TSG101陽(yáng)性對(duì)照品;S為外泌體樣品

核酸鑒定-qPCR法/NGS測(cè)序

外泌體中含有大量的RNA和DNA,包括功能性的 mRNAs、miRNAs、lncRNA、mtDNA等,這些RNA分子以外泌體為載體進(jìn)入靶細(xì)胞后,會(huì)通過(guò)不同的機(jī)制對(duì)靶細(xì)胞產(chǎn)生影響。可通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR法、高通量測(cè)序技術(shù)分析外泌體RNA分子差異,是對(duì)外泌體RNA功能研究的有效手段。

 

5 qPCR法分析細(xì)胞上清液提取出的外泌體

 

5.外泌體熒光標(biāo)記

通過(guò)對(duì)外泌體體外熒光標(biāo)記示蹤,可以對(duì)外泌體功能性進(jìn)行研究,包括蛋白組學(xué)研究、外泌體活體成像實(shí)驗(yàn)、外泌體啟動(dòng)子活性研究等。目前熒光標(biāo)記外泌體的方法有很多,主要包括親脂性染料PKH-67/PKH-26、親脂性羰花青染料DiI/DiD/DiO/DiR、以及滲透型的化合物標(biāo)記法:CFSE/CFDA/Calcein-AM等

 

6.外泌體相關(guān)FAQ

1.不同樣本提取外泌體參考體積?

 

樣本體積(參考量

樣本類(lèi)型

電鏡、NTA粒徑、Western Blot

多基因核酸分析(qPCR)、NGS測(cè)序

細(xì)胞上清*

10-20 mL

40-60 mL

血清

1 mL

2 mL

血漿

1 mL

2 mL

尿液

20 mL

50-60 mL

腦脊液

10 mL

20-30mL

精液

1-2 mL

2-5 mL

唾液

5-10 mL

10-20 mL

腹水

10-20 mL

20-40 mL

羊水

10-20 mL

20-40 mL

乳液

5 mL

10-20 mL

2.外泌體血液樣本提取需注意事項(xiàng)?

全血經(jīng)過(guò)長(zhǎng)時(shí)間放置,冷凍、離心、會(huì)發(fā)生溶血現(xiàn)象,無(wú)法提取外泌體,必須做好血清血漿的分離。以及去除血清外源的外泌體。

3.如何去除血清外源的外泌體。

a.將細(xì)胞培養(yǎng)用的血清通過(guò)1×105g超速離心10h,去除血清外泌體;b. 選擇無(wú)血清培養(yǎng)基進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)。

4.細(xì)胞上清外泌體提取試劑盒(貨號(hào):41202)可以提取哪些樣本的外泌體?

細(xì)胞上清液、尿液(可直接提?。⒛X脊液(需處理后再提?。?。其他的組織液包括體液、唾液、卵泡液、精液等提取效率較低,建議客戶(hù)用專(zhuān)門(mén)的組織液提取試劑盒。

5.如何提取組織細(xì)胞外泌體?

無(wú)菌環(huán)境下將組織剪成小塊(越小越好),然后在無(wú)血清的培養(yǎng)基中培養(yǎng)12h;將培養(yǎng)液轉(zhuǎn)移至離心管中,于4℃以3000g離心20 min去除培養(yǎng)液中雜質(zhì)和細(xì)胞碎片,將上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中;先使用0.45μm濾器過(guò)濾上清液,接著使用0.2μm濾器過(guò)濾上清液,再按照本試劑盒說(shuō)明書(shū)提取外泌體。

6.外泌體如何保存?

純化后的外泌體可于4℃保存不超過(guò)一周,-80℃條件下可長(zhǎng)期保存,避免反復(fù)凍融。

 

6.外泌體相關(guān)產(chǎn)品推薦

 

名稱(chēng)

貨號(hào)

規(guī)格

價(jià)格(元)

外泌體提取

HieffTM Quick exosome isolation kit for Cell Culture Media)細(xì)胞培養(yǎng)上清外泌體快速抽提試劑盒HOT

41201ES25/50

25 mL/50 mL

2155.00/

3855.00

HieffTM Quick exosome isolation kit for Serum/Plasma

血清/血漿外泌體快速抽提試劑盒HOT

41202ES30

30 mL

2155.00

外泌體定量

RIPA Lysis Buffer (Strong) RIPA裂解液(強(qiáng))HOT

20101ES60

100 mL

228.00

BCA Protein Quantification Kit BCA

蛋白濃度測(cè)定試劑盒(增強(qiáng)型)HOT

20201ES76

500T(100 mL)

228.00

 

外泌體鑒定(Western Blot)

Precast Protein Improve Gels, 4%-20%, 10 wells 

4%-20%高分辨率梯度預(yù)制膠,10孔HOT

36231ES10

1盒(10塊)

573.00

GoldBand 3-color Regular Range Protein Marker(10-180 kDa)三色預(yù)染蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)HOT

20351ES76

2×250 μL

585.00

外泌體標(biāo)記

DiO (DiOC18(3)) 細(xì)胞膜綠色熒光探針

40725ES10/25

10/25 mg

488.00/988.00

DiR Iodide (DiIC18(7)) 細(xì)胞膜深紅色熒光探針

40757ES25

25 mg

988.00

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