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技術(shù)革新:聚焦翌圣生物熱啟動(dòng)Taq酶雙封閉抗體

2021-11-12  閱讀(406)

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技術(shù)革新:聚焦翌圣生物熱啟動(dòng)Taq酶雙封閉抗體


非特異擴(kuò)增是PCR實(shí)驗(yàn)中的常見(jiàn)問(wèn)題,非特異擴(kuò)增直接影響檢測(cè)結(jié)果的判讀并且會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增靈敏度下降,甚至目標(biāo)片段的得率下降等。此外,檢測(cè)試劑的穩(wěn)定性也是核酸檢測(cè)行業(yè)人格外關(guān)注的問(wèn)題,不管是長(zhǎng)期儲(chǔ)存穩(wěn)定性還是短期偏離正常保存條件的穩(wěn)定性,都直接影響檢測(cè)結(jié)果的有效性。


翌圣生物科技(上海)股份有限公司(以下簡(jiǎn)稱“翌圣生物")匠心開(kāi)發(fā)熱啟動(dòng)Taq酶雙封閉抗體,通過(guò)同時(shí)封閉Taq酶的聚合酶活性及外切酶活性來(lái)有效提高擴(kuò)增的特異性及試劑的穩(wěn)定性。



PART 01

Taq酶雙封閉抗體封閉原理




傳統(tǒng)的Taq DNA聚合酶抗體可以有效抑制Taq酶的聚合酶活性,從而避免錯(cuò)配或引物二聚體引起的非特異性擴(kuò)增。然而Taq酶除了具有5'→3'聚合酶活性,還有5'→3'核酸外切酶活性,這部分外切酶活性可能會(huì)在低溫時(shí)導(dǎo)致錯(cuò)配探針或其它物料降解,造成非特異信號(hào)。翌圣生物開(kāi)發(fā)的熱啟動(dòng)Taq酶雙封閉抗體不僅可以封閉Taq酶的有5'→3'聚合酶活性,還能同時(shí)封閉Taq酶的5'→3'外切酶活性,雙管齊下,既能有效防止錯(cuò)配或引物二聚體引起的非特異性擴(kuò)增,又能防止物料降解產(chǎn)生非特異信號(hào),雙重提升試劑穩(wěn)定性。


圖片1.jpg

圖1. 翌圣雙封閉抗體封閉原理示意圖

圖中高亮部分為Taq DNA聚合酶5'→3'聚合酶活性結(jié)構(gòu)域和5'→3'核酸外切酶活性結(jié)構(gòu)域,翌圣雙封閉抗體含兩種抗體,可同時(shí)封閉Taq DNA聚合酶的5'→3'聚合酶活性和5'→3'核酸外切酶活性



PART 02

Taq酶雙封閉抗體使用方案




翌圣生物Taq酶雙封閉抗體不僅可封閉野生型Taq酶,對(duì)于多種突變體Taq酶亦可適用,封閉之后的熱啟動(dòng)Taq酶可以正常保存至-20℃。


1 µL抗體(5 mg/mL)可封閉20-50 U Taq DNA聚合酶:

•  小樣室溫(25℃)旋轉(zhuǎn)混勻孵育30 min

  大樣室溫(25℃)旋轉(zhuǎn)混勻孵育2~3 h



PART 03

Taq酶雙封閉抗體性能展示




 1  雙封閉抗體有效封閉Taq DNA聚合酶外切酶活性

將合成的引物探針?lè)謩e配于未封閉以及雙封閉抗體封閉的Taq DNA聚合酶的反應(yīng)液中,40℃反應(yīng),檢測(cè)兩者熒光信號(hào)。


圖片2.jpg

圖2. 雙封閉抗體外切酶活性封閉效率檢測(cè)

黃色:未封閉的Taq DNA聚合酶組;紫色:雙封閉抗體封閉的Taq DNA聚合酶組


由圖2可以看出雙封閉抗體可有效封閉Taq DNA聚合酶的外切酶活性。


 2   使用雙封閉抗體分型準(zhǔn)確,靈敏度更高

分別用翌圣生物雙封閉抗體以及T公司抗體對(duì)Taq酶封閉后通過(guò)ARMS-PCR技術(shù)檢測(cè)陽(yáng)性樣本。


圖3. ARMS-PCR擴(kuò)增曲線圖

藍(lán)色:T公司封閉抗體封閉;紅色:翌圣雙封閉抗體封閉


由圖3可以看到翌圣生物雙封閉抗體封閉的Taq酶在ARMS-PCR擴(kuò)增中分型準(zhǔn)確,靈敏度更高。


 3   雙封閉抗體有效提升檢測(cè)試劑穩(wěn)定性

用傳統(tǒng)封閉抗體與雙封閉抗體分別封閉Taq DNA聚合酶,配置成含引物探針的全預(yù)混液,在4℃放置10天或在37℃放置1、3、5天,擴(kuò)增10000拷貝ASFV質(zhì)粒,觀察擴(kuò)增曲線和Ct值變化,對(duì)比傳統(tǒng)封閉抗體和雙封閉抗體對(duì)全預(yù)混反應(yīng)液穩(wěn)定性的作用。

圖4. 傳統(tǒng)封閉抗體(A)、雙封閉抗體(B)封閉反應(yīng)液擴(kuò)增10000拷貝ASFV質(zhì)粒擴(kuò)增曲線圖

藍(lán)色:4℃放置10天;紅色:4℃放置0天(對(duì)照)


由圖4可以看出,雙封閉抗體比傳統(tǒng)封閉抗體更能保持反應(yīng)液穩(wěn)定,有效提升檢測(cè)試劑穩(wěn)定性。雙封閉抗體封閉含引物探針全預(yù)混液4℃放置10天擴(kuò)增曲線和Ct值無(wú)明顯變化。



圖5. 傳統(tǒng)封閉抗體(A)、雙封閉抗體(B)封閉反應(yīng)液擴(kuò)增10000拷貝ASFV質(zhì)粒擴(kuò)增曲線圖

藍(lán)色:37℃放置5天 ;綠色:37℃放置3天;黃色:37℃放置1天 ; 紅色:37℃放置0天(對(duì)照)


由圖5可以看出,雙封閉抗體比傳統(tǒng)封閉抗體更能保持反應(yīng)液穩(wěn)定,有效提升檢測(cè)試劑穩(wěn)定性。雙封閉抗體封閉含引物探針全預(yù)混液37℃放置1、3、5天Ct值差小于0.2。


 4   雙封閉抗體幫助解決基線上漂問(wèn)題

某些引物配合特定buffer和儀器時(shí),會(huì)出現(xiàn)基線上漂的情況。翌圣生物嘗試多種方法改善基線問(wèn)題,發(fā)現(xiàn)雙封閉抗體更有利于基線平穩(wěn)。



圖6. N基因(A)、ACT基因(B)擴(kuò)增曲線圖

紅色:傳統(tǒng)封閉抗體封閉;綠色:雙封閉抗體封閉


由圖6可以看出特定引物和buffer下,使用雙封閉抗體可幫助解決基線上漂問(wèn)題。


 5   使用雙封閉抗體獲得良好線性

用雙封閉抗體封閉的反應(yīng)液擴(kuò)增100000、10000、1000、100拷貝ASFV/ACT雙質(zhì)粒,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。


圖7. 雙封閉反應(yīng)液制作ASFV基因(A)、ACT基因(B)標(biāo)準(zhǔn)曲線圖


由圖7可以看到,ASFV基因標(biāo)準(zhǔn)曲線R2為0.998,擴(kuò)增效率為98.848%;ACT基因標(biāo)準(zhǔn)曲線R2為0.998,擴(kuò)增效率為98.113%,兩者線性均良好,且均無(wú)非特異性擴(kuò)增。


 6   雙封閉抗體可快速釋放酶活

分別用進(jìn)口T公司抗體和翌圣生物雙封閉抗體封閉Taq酶,并在95℃下熱激20 s,檢測(cè)酶活??梢钥吹?5℃熱激 20 s后,翌圣生物雙封閉抗體可釋放95%以上的酶活,與T公司抗體相當(dāng)。


原酶

翌圣生物雙封閉抗體(95℃,20 s)

T公司抗體(95℃,20 s)

酶活-U/μL

2.15

2.1

2.2



 7   雙封閉抗體可封閉多種類型Taq

用翌圣生物雙封閉抗體(Cat#31303)分別封閉三種類型Taq酶(野生型+2種突變型),封閉比例為1μg:5U,測(cè)量熒光值以及封閉效率??梢钥吹剑瑢?duì)于不同類型的Taq酶,翌圣生物雙封閉抗體(Cat#31303)封閉效果均較好。



熒光值

封閉效率

空白

6461.74


原酶-Taq000

56221.33


原酶-Taq019E

50819.64


原酶-Taq019H

56466.33


31303-Taq000

7949.68

97.01%

31303-Taq019E

8267.35

95.93%

31303-Taq019H

8015.47

96.90%


 8 
  
Yeasen雙封閉抗體無(wú)小鼠基因組殘留

以水為模板作為陰性對(duì)照,小鼠基因組為模板作為陽(yáng)性對(duì)照,擴(kuò)增不同批次的31303,觀察條帶,發(fā)現(xiàn)樣品未擴(kuò)增出目的片段,說(shuō)明抗體不存在小鼠基因組殘留。


圖片8.jpg

圖8. 小鼠基因組殘留檢測(cè)圖

注:-為陰性對(duì)照,+為陽(yáng)性對(duì)照,1-5為31303不同批次樣品



PART 04

翌圣生物Taq酶抗體庫(kù),滿足您的多樣化需求




市面上Taq酶突變體種類較多,往往很難找到適配且能高效封閉的抗體,而選擇其他的修飾方式,可能存在修飾效果不佳、熱啟動(dòng)時(shí)間過(guò)長(zhǎng)等問(wèn)題。
翌圣生物擁有多種Taq酶抗體組成的抗體庫(kù),除常用的聚合酶活性封閉抗體、5'→3'外切酶活性封閉抗體和雙封閉抗體以外,抗體庫(kù)中還有40余株抗體,后續(xù)可快速開(kāi)發(fā)實(shí)現(xiàn)超過(guò)200余株抗體,可針對(duì)各種商業(yè)化Taq酶進(jìn)行定制化篩選適配封閉抗體,幫助IVD企業(yè)快速適配原料縮短研發(fā)進(jìn)程。
抗體庫(kù)定制篩選案例展示:
2020年6月12日,客戶C反饋使用翌圣生物通用版Taq酶抗體封閉某Taq酶突變體,封閉效率可達(dá)95%,但希望37℃穩(wěn)定性測(cè)試能突破7天,嘗試優(yōu)化封閉比例未能解決該問(wèn)題,遂安排寄送客戶的Taq酶至翌圣生物IVD RDC。同年7月20日,翌圣生物從其Taq酶抗體庫(kù)里進(jìn)行篩選,篩選到#301號(hào)聚合酶封閉抗體與#2號(hào)外切酶封閉抗體對(duì)客戶Taq酶有良好的封閉性,混合使用兩種抗體可使Taq酶37℃穩(wěn)定性測(cè)試延長(zhǎng)至14天。


創(chuàng)新合作模式下的定制化封閉抗體篩選,翌圣生物Taq酶抗體庫(kù)給您多種選擇!


目前翌圣生物為IVD企業(yè)已提供的定制化服務(wù)除了Taq酶封閉抗體篩選外,其他分子診斷原料包括:免提取、快速程序、自動(dòng)化儀器適配、小體積反應(yīng)體系、酶定向改造、防污染體系、凍干試劑等,幫助數(shù)百個(gè)分子診斷試劑開(kāi)發(fā)項(xiàng)目順利進(jìn)行,快速推向臨床實(shí)驗(yàn)階段。



如果您對(duì)創(chuàng)新合作模式感興趣,歡迎聯(lián)系我們,探討交流,我們期待與您的合作!




PART 05

產(chǎn)品信息




產(chǎn)品名稱

貨號(hào)

規(guī)格

價(jià)格(元)

*(元)

Hieff® Double-Block anti-Taq DNA Polymerase Antibody 

 

31303ES60

100 μg

1153.00

229.00

31303ES80

1 mg

3653.00

1479.00

31303ES90

5 mg

14653.00

6159.00

31303ES92

10 mg

26353.00

11189.00

31303ES93

100 mg

231753.00

74599.00

31303ES94

1000 mg

1969552.00

499999.00



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