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DNA-蛋白質(zhì)互作研究解決方案(下)
DNA-蛋白質(zhì)互作研究解決方案(上)介紹了一些表觀組學(xué)技術(shù)研究DNA-蛋白質(zhì)互作,但是有了組學(xué)數(shù)據(jù),通常還需要一些驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。
這次,我們來(lái)介紹DNA與蛋白質(zhì)互作研究的驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。
熒光素酶報(bào)告基因是指以熒光素(luciferin)為底物來(lái)檢測(cè)螢火蟲(chóng)熒光素酶(fireflyluciferase)活性的一種報(bào)告系統(tǒng)。熒光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的過(guò)程中,會(huì)發(fā)出生物熒光(bioluminescence)。
雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蜻M(jìn)行啟動(dòng)子活性檢測(cè)、轉(zhuǎn)錄因子鑒定、miRNA 與LncRNA/circRNA/mRNA互作等。
圖.轉(zhuǎn)錄因子IRF3對(duì)IFN-β啟動(dòng)子的調(diào)控作用
構(gòu)建Luc-IFN-β啟動(dòng)子載體和IRF3的過(guò)表達(dá)載體后進(jìn)行共轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn),之后雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)顯示轉(zhuǎn)錄因子IRF3對(duì)IFN-β具有調(diào)控作用
產(chǎn)品名稱(chēng) | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒HOT | 11402ES60/80 | 100 T/1000 T |
Luciferase Reporter Gene Assay Kit 螢火蟲(chóng)熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒 | 11401ES60/76/80 | 100 T/500 T/1000 T |
pGM-CMV Luciferase Reporter Plasmid Positive Control pGM-CMV-Luc熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒陽(yáng)性對(duì)照 | 11556ES03 | 1 μg |
Luciferase Reporter Plasmid negative control (熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒陰性對(duì)照) | 11555ES03 | 1 μg |
pGMLR-CMV Luciferase Reporter Plasmid(pGMLR-CMV海腎熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒) | 11558ES03 | 1 μg |
酵母雙雜交是將待研究的兩種蛋白質(zhì)分別克?。ㄈ诤希┑浇湍副磉_(dá)質(zhì)粒的轉(zhuǎn)錄激活因子(如GAL4等)的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA-BD)和轉(zhuǎn)錄激活域(AD)上,構(gòu)建成融合表達(dá)載體,從表達(dá)產(chǎn)物分析兩種蛋白質(zhì)相互作用的系統(tǒng)。
CoIP | GST-pull down | 酵母雙雜交 | |
原理 | 抗原抗體特異性反應(yīng) | GST對(duì)谷胱甘肽偶聯(lián)磁珠得特異性 | 真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控過(guò)程 |
檢測(cè)瞬時(shí)相互作用 | 否 | 否 | 是 |
檢測(cè)弱相互作用 | 否 | 否 | 是 |
檢測(cè)直接相互作用 | 否 | 是 | 否 |
驗(yàn)證方式 | 體內(nèi)直接或間接相互作用檢測(cè) | 體外直接得相互作用檢測(cè) | 體內(nèi)直接或間接相互作用檢測(cè) |
是否需要蛋白純化 | 否 | 是 | 否 |
是否需要抗體 | 是 | 否 | 否 |
CoIP實(shí)驗(yàn)步驟
GST-pull down實(shí)驗(yàn)步驟
酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)步驟
產(chǎn)品名稱(chēng) | 貨號(hào) | 規(guī)格 |
蛋白A/G瓊脂糖純化樹(shù)脂 | 36403ES03/05/08/25/60 | 1/2/5/25/100 mL |
蛋白A/G瓊脂糖快速純化樹(shù)脂 | 36404ES08/25/60 | 5 /25 /100 mL |
蛋白A/G免疫沉淀磁珠 | 36417ES03/08 | 1/5 mL |
GSTSep Glutathione MagBeads GST標(biāo)簽蛋白純化磁珠 | 20562ES03/05/08/25 | 1/2/5/25 mL |
X-α-Gal 5-溴-4-氯-3-吲哚-α-D-吡喃半乳糖苷 | 10903ES25/60/72/76 | 25/100/250/500 mg |
Aureobasidin A(AbA) 金擔(dān)子素A | 60231ES03/08/10 | 1/5/10 mg |
WB/IP裂解液 | 20118ES60 | 100 mL |
蛋白酶抑制劑Cocktail | 20124ES03/10/60/76 | 1/10/100/500 mL |