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漲知識(shí) | 克隆專(zhuān)題二:不同分子克隆方法介紹(下)
克隆是英文“clone"或“cloning"的音譯,而英文“clone"則起源于希臘文“Klone",原意是指以幼苗或嫩枝插條。1963年J.B.S.Haldane在題為“人類(lèi)種族在未來(lái)二萬(wàn)年的生物可能性"的演講上采用“克?。–lone)"的術(shù)語(yǔ),把“克隆技術(shù)"帶到了人們的視野中。
克隆技術(shù)又稱(chēng)為“生物放大技術(shù)",目前應(yīng)用泛的技術(shù)為“分子克隆",又稱(chēng)重組DNA技術(shù),即通過(guò)重組技術(shù)將目的DNA片段按照人們的設(shè)計(jì)定向連接起來(lái),在特定的受體細(xì)胞中與載體同時(shí)復(fù)制并得到表達(dá),產(chǎn)生新的遺傳性狀的技術(shù)。
之前小翌給小伙伴們介紹了常規(guī)的分子克隆方法,接下來(lái)繼續(xù)帶領(lǐng)大家認(rèn)識(shí)一下新的、非常規(guī)的分子克隆技術(shù),包括無(wú)縫克隆中的Golden Gate技術(shù)、Gateway技術(shù)、不依賴(lài)基因序列和連接反應(yīng)的克隆方法等等。
Golden Gate克隆技術(shù)通過(guò)TypeIIS型限制性?xún)?nèi)切酶(翌圣BsmBI Cat#15203ES、BspQI限制性?xún)?nèi)切酶Cat#15202ES、FuniCut™ BsaI Cat#15005ES)識(shí)別目的序列以外的四個(gè)堿基,剪切后獲得粘性末端,直接用于目的片段的連接。通過(guò)連接酶(翌圣T4 DNA連接酶Cat#10300)連接形成重組質(zhì)粒,使用轉(zhuǎn)化技術(shù)轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞中,由于限制性?xún)?nèi)切酶的特性,酶切連接后酶切位點(diǎn)不再存在,能達(dá)到精確的無(wú)縫克隆。Engler等人利用該技術(shù)成功連接了9個(gè)目的片段,連接率達(dá)90%以上。
圖1. Golden Gate Assembly克隆原理示意圖【1】
圖2. Gateway技術(shù)構(gòu)建表達(dá)載體【2】
基本操作流程如下:
圖3. SLIC法構(gòu)建表達(dá)載體的步驟【3】
其具體的操作步驟是,利用PCR技術(shù)在目的片段兩側(cè)分別加上20-25 bp的同源序列,用DpnI酶(翌圣FuniCut™ DpnI Cat#15052ES)消化處理,組裝片段按合適的比例混勻,加入大腸桿菌細(xì)胞裂解物,37℃反應(yīng)1 h,然后直接轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,即可實(shí)現(xiàn)體外無(wú)痕組裝DNA。
圖4. SLiCE技術(shù)【4】
產(chǎn)品定位 | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 產(chǎn)品貨號(hào) | 規(guī)格 |
Golden Gate組裝 | BspQI限制性?xún)?nèi)切酶 (10 U/μL) | 15202ES76 | 500 U |
Golden Gate組裝 | BsmBI(10 U/μL) | 15203ES80 | 1000 U |
通用緩沖液,5min完成精準(zhǔn)酶切 | FuniCut™快速限制性?xún)?nèi)切酶 | 15001ES-15051ES | 50 T |
T4連接 | Hieff® Gold T4 DNA Ligase | 10300ES80 | 1000 U |
5 min快速完成感受態(tài)轉(zhuǎn)化 | F DH5α化學(xué)感受態(tài) | 11803ES80 | 10×100 μL |
常規(guī)化學(xué)感受態(tài) | DH5α 化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞 | 11802ES80 | 10×100 μL |
常規(guī)化學(xué)感受態(tài) | 化學(xué)感受態(tài)細(xì)胞 | 11801ES80 | 10×100 μL |
常規(guī)PCR | 2×Hieff® PCR Master Mix(With Dye) | 10102ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
常規(guī)PCR,不含染料 | 2×Hieff® PCR Master Mix(No Dye) | 10103ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
快速PCR,快至1s/kb | 2×Hieff® Ultra-Rapid HotStart PCR Master Mix(with Dye) | 10157ES03/08 | 1 mL/5×1 mL |
2.林春晶, 韋正乙, 蔡勤安等. 幾種植物轉(zhuǎn)基因表達(dá)載體的構(gòu)建方法[J].生物技術(shù), 2008(05): 84-87.
3.張陽(yáng)璞, 楊淑慎. 幾種新型植物基因表達(dá)載體的構(gòu)建方法[J].生物工程學(xué)報(bào), 2015, 31(03): 311-327.
4.楊發(fā)譽(yù), 楊云彭, 霍毅欣. 合成生物學(xué)中不依賴(lài)限制性?xún)?nèi)切酶的分子克隆策略[J].中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào), 2018, 34(04): 364-370.