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你是否曾想過,為什么有些植物一年只開一次花,而有些植物卻可以年年開花?這背后,其實(shí)有著復(fù)雜的遺傳機(jī)制。
在植物學(xué)中,一年生植物會(huì)在一年的周期中經(jīng)歷發(fā)芽、生長(zhǎng)、開花、結(jié)果,直至死亡。比如大豆、玉米、土豆等作物。而多年生植物在開花、結(jié)果、枝葉老去之后,在來年依舊能萌發(fā)新芽,循環(huán)往復(fù),歷經(jīng)數(shù)年,如冬小麥、白菜、胡蘿卜等。一年生與多年生植物之間并不存在著一道界線分明的分水嶺。比如,紅薯、鼠曲草在日本屬于一年生草本植物,而在熱帶地區(qū)它們卻成了多年生植物。人們對(duì)于轉(zhuǎn)變背后的進(jìn)化模式和遺傳基礎(chǔ)仍然知之甚少。
在追求農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的今天,多年生作物的重要性不言而喻。它們不僅能夠減少農(nóng)業(yè)勞動(dòng)力的投入,降低生產(chǎn)成本,還能對(duì)環(huán)境保護(hù)產(chǎn)生積極影響。但是多年生作物的繁殖難題一直是農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的挑戰(zhàn)。那么,到底是什么遺傳機(jī)制調(diào)控一年生轉(zhuǎn)變?yōu)槎嗄晟参锬兀课覀兡芊窠馕鲞@種轉(zhuǎn)變機(jī)制,進(jìn)而調(diào)控植物的生長(zhǎng)周期,為農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展出一份力,實(shí)現(xiàn)年年豐收的愿景呢?
2024年5月28日,國(guó)際頂級(jí)期刊Cell在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)創(chuàng)新中心王佳偉團(tuán)隊(duì)的最新研究:“Reciprocal conversion between annual and polycarpic perennial flowering behavior in the Brassicaceae"。該研究揭示了十字花科植物中,一年生和多果多年生開花行為的轉(zhuǎn)變機(jī)制,并利用基因編輯技術(shù)成功將一年生植物變成多年生植物,為培育新型多年生作物提供了理論基礎(chǔ)。
圖1. 一年生與多年生植物轉(zhuǎn)化模型(圖片來自原文)
研究人員首先對(duì)十字花科的所有屬進(jìn)行了篩選比較,獲得了兩個(gè)二倍體多果多年生物種作為模型進(jìn)行研究,分別是來自SENDAI擬南芥種子儲(chǔ)備中心(SASSC)的喜馬拉雅須彌芥(Crucihimalaya himalaica)和來自USDA-ARS種質(zhì)資源信息網(wǎng)絡(luò)(GRIN)的內(nèi)華達(dá)糖芥(E. nevadense),喜馬拉雅須彌芥生長(zhǎng)在青藏高原,是研究環(huán)境下物種形成和生態(tài)適應(yīng)的新模型系統(tǒng),而內(nèi)華達(dá)糖芥是內(nèi)華達(dá)山脈山峰的種。對(duì)他們?cè)谏L(zhǎng)室條件下的生長(zhǎng)習(xí)性進(jìn)行表征,E. nevadense在長(zhǎng)日照(LDs)中表現(xiàn)出與C. himalaica相當(dāng)?shù)拈_花表型(圖2),且經(jīng)過兩個(gè)月的冷處理之后可以進(jìn)行新一輪的開花。表明在研究人員的生長(zhǎng)室條件下,喜馬拉雅須彌芥和內(nèi)華達(dá)糖芥都是典型的多年生多果植物。
圖2. 兩種多果多年生模型的表征(圖片來自原文)
為了進(jìn)行系統(tǒng)的遺傳學(xué)研究,研究人員又篩選出了與喜馬拉雅須彌芥和內(nèi)華達(dá)糖芥同屬的植物,一次結(jié)果一年生植物小花糖芥(Erysimum cheiranthoides)和呈現(xiàn)出兼性冬性一年生/多次結(jié)實(shí)多年生特征的卵葉須彌芥(Crucihimalaya wallichii)。
在此基礎(chǔ)上,研究團(tuán)隊(duì)利用基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)四種植物的基因組進(jìn)行了測(cè)序和組裝,獲得了這些植物的基因組信息,并通過基因定位技術(shù)確定了兩個(gè)屬中負(fù)責(zé)開花行為自然變異的基因。如圖3,在須彌芥屬和糖芥屬中都成功定位到了三個(gè)基因區(qū)間(FLC、FLM和MAF)。通過比對(duì)模式生物擬南芥的基因功能注釋,結(jié)果顯示這三個(gè)遺傳區(qū)間內(nèi)存在一類親緣關(guān)系密切的MADS-box轉(zhuǎn)錄因子編碼基因,它們都具有抑制植物開花(生殖生長(zhǎng))的功能。
圖3. 春化需求和多年生多果植物生長(zhǎng)習(xí)性的遺傳圖譜(圖片來自原文)
研究人員利用基因克隆和表達(dá)分析技術(shù),研究了三種基因(FLC、FLM和MAF)在植物開花行為中的作用。首先,通過CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)生成FLC、FLM和MAF基因的功能缺失突變體,即在編碼區(qū)內(nèi)或兩側(cè)設(shè)計(jì)兩個(gè)單向?qū)NA(sgRNAs),創(chuàng)建了具有大片段缺失的突變體。在喜馬拉雅須彌芥中獲得了FLC、FLM和MAF的單一突變體,分別將其命名為Chflc、Chflm和Chmaf。
圖4. 須彌芥屬和糖芥屬中類FLC MADS-box基因突變體的生成(圖片來自原文)
其次,觀察突變體的表型變化。3個(gè)突變體在春化之后都可以恢復(fù)營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)(即形成新的營(yíng)養(yǎng)芽,如圖5A所示),都顯示出了對(duì)于春化的需求。與Chflc和Chflm突變株相比,Chmaf需要更長(zhǎng)時(shí)間的冷處理(18周)才能飽和春化需求。結(jié)果顯示,FLC、FLM和MAF基因之間存在功能冗余,其中任何一種基因的突變都會(huì)影響植物的開花時(shí)間,但不同基因的影響程度不同。
圖5. 喜馬拉雅須彌芥和卵葉須彌芥類FLC的MADS-box基因突變體的開花時(shí)間和胎次(圖片來自原文)
接著,通過雜交手段將突變基因以不同的方式組合,成功再現(xiàn)了植物從多次結(jié)實(shí)多年生逐漸演化為二年生再轉(zhuǎn)變?yōu)橐荒晟能壽E:當(dāng)FLC、FLM和MAF三個(gè)基因都保持功能完好時(shí),植物表現(xiàn)出穩(wěn)健的多次結(jié)實(shí)多年生表型。缺失其中一個(gè)或兩個(gè)基因會(huì)導(dǎo)致植物出現(xiàn)兼史策略,Chflc Chflm雙突變體表現(xiàn)出冬季一年生表型,在LDs中產(chǎn)生150片葉子后開花(圖5C),春化可以加速開花(圖5E),即從多年生植物轉(zhuǎn)變?yōu)榱硕晟参铮?span style="box-sizing: border-box;padding: 0px;-webkit-tap-highlight-color: transparent">Chflc Chflm突變體顯示出了一年生表型,當(dāng)在LDs中連續(xù)生長(zhǎng)時(shí),Chflc Chflm植物最終可以開花(圖5A)。而當(dāng)三個(gè)基因缺失時(shí),Chflc Chflm Chmaf三突變體植物轉(zhuǎn)變?yōu)橐荒晟参铮▓D5B和5C)。這些發(fā)現(xiàn)與繪圖(圖1)結(jié)果一致,并表明以下幾點(diǎn):
ChFLC、ChFLM和ChMAF對(duì)春化的調(diào)控存在功能冗余;
ChFLC和ChFLM的共同作用確保了喜馬拉雅多果多年生生長(zhǎng)習(xí)性;
ChMAF強(qiáng)烈抑制開花,主要在春化中發(fā)揮作用。
為了更深入地研究這些基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制,研究人員利用染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序(ChIP-seq)和RNA測(cè)序(RNA-seq)技術(shù),研究了類FLC基因與染色質(zhì)結(jié)合的位點(diǎn)和下游靶基因的表達(dá)變化。揭示了從多果多年生到二年和一年生開花行為的轉(zhuǎn)變是由三個(gè)密切相關(guān)的MADS-box基因的劑量決定的連續(xù)體。多年生植物中,類FLC基因在低溫處理后表達(dá)量會(huì)降低,隨后恢復(fù),這與多年生植物可以多次開花的特性相符。這些基因的表達(dá)模式、功能強(qiáng)度和組合的多樣化賦予了物種采用各種生活史策略的潛力。
圖6. 小花糖芥中NILs的開花時(shí)間和胎次(圖片來自原文)
最后,研究人員利用轉(zhuǎn)基因技術(shù),嘗試培育了一種多果多年生開花甘藍(lán)型油菜植物。通過構(gòu)建轉(zhuǎn)基因植物,實(shí)現(xiàn)多年生類FLC基因的高表達(dá)水平,如圖7,在春化后可以恢復(fù)營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng),這些一年生植物變成了多年生植物,可以多次開花。
圖7. 十字花科一年生植物向多果多年生開花植物的轉(zhuǎn)化(圖片來自原文)
這項(xiàng)研究揭示了植物生命周期轉(zhuǎn)變的遺傳機(jī)制,為培育新的多年生作物提供了理論基礎(chǔ)。通過改變植物中類FLC基因的表達(dá),可以培育出適應(yīng)不同環(huán)境和需求的多年生作物,例如,培育多年生蔬菜可以減少農(nóng)民的勞動(dòng)強(qiáng)度,降低生產(chǎn)成本,并減少化肥和農(nóng)藥的使用,從而更加環(huán)保。培育多年生花卉可以美化環(huán)境,減少城市綠化成本,并提高城市生態(tài)效益。此外,培育多年生作物還可以提高土地利用率,減少耕作次數(shù),并增加土壤有機(jī)質(zhì),從而提高土壤肥力。
當(dāng)然,還有許多問題需要解決,如這三個(gè)基因極有可能在控制植物壽命方面也起著冗余作用,但其確切機(jī)制有待進(jìn)一步研究。盡管研發(fā)人員能夠在生長(zhǎng)室條件下恢復(fù)冬生甘油菜在春化后的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng),但尚不清楚這些植物在田間是否能表現(xiàn)為真正的多果多年生植物。讓我們一起期待未來研發(fā)人員的進(jìn)一步研究!
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在該研究中,研究團(tuán)隊(duì)使用了翌圣生物PCR Mix試劑進(jìn)行基因鑒定等實(shí)驗(yàn):
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中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)創(chuàng)新中心
實(shí)驗(yàn)信息:目的片段3,000 bp
圖8. 10167擴(kuò)增3 kb大腸桿菌菌落,擴(kuò)增效率高,產(chǎn)量高,性能優(yōu)于競(jìng)品。延伸時(shí)間40 sec,循環(huán)數(shù)35 cycles??偡磻?yīng)體系10 μL。
客戶評(píng)價(jià):本產(chǎn)品進(jìn)行大腸桿菌菌P鑒定很適合而且擴(kuò)增速度很快,大大的表揚(yáng)!
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