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如何定量低豐度目的基因的表達(dá)(含詳細(xì)解決方法)有時(shí)候,qPCR實(shí)驗(yàn)會(huì)成為阻礙你課題順利開展的強(qiáng)勢(shì)攔路虎!看似簡(jiǎn)單的基因表達(dá)量差異驗(yàn)證,當(dāng)遇到低豐富表達(dá)的基因時(shí),也許就舉步維艱。模板獲取困難導(dǎo)致的RNA提取量少或RNA質(zhì)量不佳,即使選蕞佳的試劑、篩選出良好的引物,也有可能qPCR定量得到的內(nèi)參基因CT值在18-20個(gè)cycle,而目的基因在31-35個(gè)循環(huán)。遇到這種情況,你是怎么解決的呢?qPCR在低豐度表達(dá)基因定量中的局限性基因的豐度是指基因在基因組中的拷貝數(shù)??煞譃楦哓S度,中等豐度和低豐度。低
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NGS測(cè)序技術(shù)近年來得到了巨大發(fā)展,2017年摩根大會(huì)上,Illumina重磅推出NovaSeq測(cè)序儀,NovaSeq可以2天產(chǎn)生2Tb數(shù)據(jù),通量是10年前GenomeAnalyzer的2000倍。測(cè)序通量的大幅增加,意味著更多的樣本混合上機(jī),這樣的話我們?nèi)绾卧诿C?shù)據(jù)中找到對(duì)應(yīng)樣本匹配的數(shù)據(jù)呢?人們想到了一種在文庫構(gòu)建時(shí)在接頭上添加“接頭暗號(hào)”的方法,在測(cè)序完成之后根據(jù)“接頭暗號(hào)”對(duì)樣本進(jìn)行分離。這里的接頭暗號(hào)就是樣本標(biāo)簽“Index/Barcode”。本文將以建庫過程中要添加的接頭為核心,對(duì)
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dsDNA HS Assay Kit for Qubit®數(shù)據(jù)測(cè)評(píng)
行走江湖靠的就是實(shí)力dsDNAHSAssayKitforQubit®數(shù)據(jù)測(cè)評(píng)——簡(jiǎn)便、靈敏、準(zhǔn)確、穩(wěn)定dsDNAAssayKitforQubit®是Yeasen生物開發(fā)的專門用于Qubit®熒光儀或熒光酶標(biāo)儀的試劑盒,線性范圍0.2-100ng,即使在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下,也可以選擇性的檢測(cè)dsDNA,且耐受較高濃度的蛋白質(zhì)、鹽類、洗滌劑等污染物。產(chǎn)品名稱產(chǎn)品編號(hào)規(guī)格儲(chǔ)存dsDNAHSAssayKitforQubit®12640ES60100T2-8℃dsDNAHSAssa -
文獻(xiàn) | Molecular Plant: 解密水稻半矮桿與應(yīng)用之謎
文獻(xiàn)|MolecularPlant:解密水稻半矮桿與應(yīng)用之謎倒伏是影響水稻高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的主要限制因素之一。自20世紀(jì)60年代以來,以作物矮化育種為標(biāo)志的“綠色革命”主要是利用赤霉素合成基因SD1的突變體,培育半矮稈性狀,提高作物(水稻)的抗倒伏能力,使水稻產(chǎn)量得到了大面積的顯著增加。經(jīng)過多年研究,雖然在水稻中發(fā)現(xiàn)了超過60個(gè)基因可以導(dǎo)致半矮稈性狀,但這些基因除影響莖稈長(zhǎng)度還影響其它農(nóng)藝性狀,難以應(yīng)用于培育抗倒伏品種。目前,SD1的突變?nèi)匀皇桥嘤景氚捫誀畹闹饕颉S捎趩我坏目捎没颍沟狗誀?/div>作為DNA分選磁珠的生產(chǎn)廠商,我們zui經(jīng)常被客戶問到的問題就是:高通量測(cè)序(NGS)文庫制備時(shí),DNA磁珠為什么可以用來純化和分選文庫?在這里我們整理相關(guān)的資料,對(duì)這個(gè)問題做簡(jiǎn)單的闡述。分選磁珠的作用原理是基于一種固相載體可逆化固定(SPRI)的分離純化方法。磁珠體系中一般包含:磁珠、DNA、聚乙二醇(PEG)、以及鹽離子等,在一定濃度的PEG和鹽離子環(huán)境中,DNA可吸附到羧基修飾的高分子磁珠表面(即固相載體),該過程是可逆的,在適當(dāng)條件下,結(jié)合的DNA分子可以被洗脫回收。納米級(jí)別的磁珠表面性一、WesternBlot實(shí)驗(yàn)原理蛋白免疫印跡(WesternBlot,WB)是將蛋白質(zhì)經(jīng)電泳分離后轉(zhuǎn)移到膜上,然后利用抗體進(jìn)行檢測(cè)的技術(shù)。完整的WB流程,如下圖所示,包含樣本制備、SDS-PAGE、轉(zhuǎn)膜、抗體結(jié)合、蛋白檢測(cè)等5個(gè)大步驟。二、試劑準(zhǔn)備詳見文末附錄。三、實(shí)驗(yàn)步驟1.樣本制備1)融解RIPA裂解液,混勻。取適當(dāng)量的裂解液,在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入PMSF,使PMSF的zui終濃度為1mM。2)貼壁細(xì)胞:去除培養(yǎng)液,用PBS、生理鹽水或無血清培養(yǎng)液洗一遍。按照6孔板每孔加入150-250μ1.什么是RIPA裂解液?RIPA裂解液(RadioImmunoprecipitationAssayLysisbuffer,放射免疫沉淀法裂解緩沖液)是一種傳統(tǒng)的可用于裂解細(xì)胞或組織的快速裂解液,其原理為利用表面活性劑等裂解細(xì)胞膜(包括核膜),從組織或細(xì)胞中抽取可溶性蛋白。RIPA裂解液裂解后得到的蛋白一般可直接用于常規(guī)的WB、IP、co-IP等實(shí)驗(yàn)。2.RIPA裂解液里有什么?RIPA裂解液的配制方法有很多種,主要包括裂解成分、蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑三種組分。裂解成分可通過破壞細(xì)胞膜和蛋白BenzonaseNuclease高活力核酸酶——消滅核酸,拒絕污染1.前言核酸污染是生物樣本制備中常常遇到的問題。在蛋白純化的過程中,如果您提取的蛋白粘度很高、蛋白純化的得率很低、蛋白檢測(cè)的結(jié)果很差,那么您的樣本可能遭受了核酸污染。如何去除核酸?超聲法和DNase/RNase酶法是常用的方法,但存在諸多缺陷(表1)。表1核酸去除,超聲法與DNase/RNase酶法優(yōu)缺點(diǎn)超聲法DNase/RNase酶法優(yōu)點(diǎn)利用剪切力可在一定程度上降解核酸利用核酸內(nèi)切酶活性,可在溫和條件下,較好的消化核酸缺點(diǎn)僅能
翌圣生物科技(上海)股份有限公司 - 主營(yíng)產(chǎn)品: 抗體,小分子抑制劑,熒光染料,干細(xì)胞培養(yǎng),血清
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