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  • 10 min ，get甲基化研究速成指南

    什么是DNA甲基化DNA甲基化（DNAmethylation）是DNA化學(xué)修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下改變遺傳表現(xiàn)。DNA甲基化是指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共價(jià)鍵結(jié)合一個(gè)甲基基團(tuán)。DNA甲基化的結(jié)果，一般是使甲基化位點(diǎn)的下游基因表達(dá)量變少。圖1：DNA甲基化原理圖為什么研究DNA甲基化DNA甲基化是早發(fā)現(xiàn)的基因表觀修飾方式之一，可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化在維持細(xì)胞正常功能、傳遞基因組印記、胚胎發(fā)育、腫瘤發(fā)生等方面發(fā)揮重要作

  • 小分子化合物專題

    小分子化合物專題一、信號(hào)通路信號(hào)通路是指當(dāng)細(xì)胞里要發(fā)生某種反應(yīng)時(shí)信號(hào)從細(xì)胞外到細(xì)胞內(nèi)傳遞了一種信息，細(xì)胞要根據(jù)這種信息來(lái)做出反應(yīng)的現(xiàn)象。信號(hào)通路（signalpathway）的提出早可追溯到1972年，不過(guò)當(dāng)時(shí)被稱為信號(hào)轉(zhuǎn)換（signaltransmission）。1980年M.Rodbell在一篇綜述中提到信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)（signaltransduction），此后該概念就被廣泛使用了。信號(hào)通路是指能將細(xì)胞外的分子信號(hào)經(jīng)細(xì)胞膜傳入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮效應(yīng)的一系列酶促反應(yīng)通路。這些細(xì)胞外的分子信號(hào)（稱為配體，l

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    新品速遞---“一步法”建庫(kù)試劑盒-----HieffNGS®OnePotDNALibraryPrepKitforIllumina®?產(chǎn)品背景：DNA文庫(kù)的構(gòu)建是二代測(cè)序前期的核心環(huán)節(jié)。目前市面上推廣的建庫(kù)試劑盒主要有常規(guī)建庫(kù)試劑盒以及轉(zhuǎn)座酶法快速建庫(kù)試劑盒。常規(guī)試劑盒需要購(gòu)買單獨(dú)的片段化模塊或者采用機(jī)械法進(jìn)行片段化，機(jī)械法片段化對(duì)DNA分子有一定的損傷，影響文庫(kù)質(zhì)量。轉(zhuǎn)座酶法試劑盒都是針對(duì)特定InputDNA量的樣本進(jìn)行建庫(kù)，并且存在一定的偏好性，影響測(cè)序質(zhì)量。HieffNGS®OnePotD

  • 如何定量低豐度目的基因的表達(dá)

    如何定量低豐度目的基因的表達(dá)（含詳細(xì)解決方法）有時(shí)候，qPCR實(shí)驗(yàn)會(huì)成為阻礙你課題順利開展的強(qiáng)勢(shì)攔路虎！看似簡(jiǎn)單的基因表達(dá)量差異驗(yàn)證，當(dāng)遇到低豐富表達(dá)的基因時(shí)，也許就舉步維艱。模板獲取困難導(dǎo)致的RNA提取量少或RNA質(zhì)量不佳，即使選蕞佳的試劑、篩選出良好的引物，也有可能qPCR定量得到的內(nèi)參基因CT值在18-20個(gè)cycle，而目的基因在31-35個(gè)循環(huán)。遇到這種情況，你是怎么解決的呢？qPCR在低豐度表達(dá)基因定量中的局限性基因的豐度是指基因在基因組中的拷貝數(shù)。可分為高豐度，中等豐度和低豐度。低

  • 一文全面解析NGS接頭的奧秘

    NGS測(cè)序技術(shù)近年來(lái)得到了巨大發(fā)展，2017年摩根大會(huì)上，Illumina重磅推出NovaSeq測(cè)序儀，NovaSeq可以2天產(chǎn)生2Tb數(shù)據(jù)，通量是10年前GenomeAnalyzer的2000倍。測(cè)序通量的大幅增加，意味著更多的樣本混合上機(jī)，這樣的話我們?nèi)绾卧诿Ｃ?shù)據(jù)中找到對(duì)應(yīng)樣本匹配的數(shù)據(jù)呢？人們想到了一種在文庫(kù)構(gòu)建時(shí)在接頭上添加“接頭暗號(hào)”的方法，在測(cè)序完成之后根據(jù)“接頭暗號(hào)”對(duì)樣本進(jìn)行分離。這里的接頭暗號(hào)就是樣本標(biāo)簽“Index/Barcode”。本文將以建庫(kù)過(guò)程中要添加的接頭為核心，對(duì)

  • dsDNA HS Assay Kit for Qubit®數(shù)據(jù)測(cè)評(píng)

    行走江湖靠的就是實(shí)力dsDNAHSAssayKitforQubit®數(shù)據(jù)測(cè)評(píng)——簡(jiǎn)便、靈敏、準(zhǔn)確、穩(wěn)定dsDNAAssayKitforQubit®是Yeasen生物開發(fā)的專門用于Qubit®熒光儀或熒光酶標(biāo)儀的試劑盒，線性范圍0.2-100ng，即使在存在ssDNA、RNA和單體核苷酸的條件下，也可以選擇性的檢測(cè)dsDNA，且耐受較高濃度的蛋白質(zhì)、鹽類、洗滌劑等污染物。產(chǎn)品名稱產(chǎn)品編號(hào)規(guī)格儲(chǔ)存dsDNAHSAssayKitforQubit®12640ES60100T2-8℃dsDNAHSAssa

  • 文獻(xiàn) | Molecular Plant: 解密水稻半矮桿與應(yīng)用之謎

    文獻(xiàn)|MolecularPlant:解密水稻半矮桿與應(yīng)用之謎倒伏是影響水稻高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的主要限制因素之一。自20世紀(jì)60年代以來(lái)，以作物矮化育種為標(biāo)志的“綠色革命”主要是利用赤霉素合成基因SD1的突變體，培育半矮稈性狀，提高作物（水稻）的抗倒伏能力，使水稻產(chǎn)量得到了大面積的顯著增加。經(jīng)過(guò)多年研究，雖然在水稻中發(fā)現(xiàn)了超過(guò)60個(gè)基因可以導(dǎo)致半矮稈性狀，但這些基因除影響莖稈長(zhǎng)度還影響其它農(nóng)藝性狀，難以應(yīng)用于培育抗倒伏品種。目前，SD1的突變?nèi)匀皇桥嘤景氚捫誀畹闹饕?。由于單一的可用基因，抗倒伏性?/div>

  • 淺談DNA磁珠的作用原理

    作為DNA分選磁珠的生產(chǎn)廠商，我們zui經(jīng)常被客戶問(wèn)到的問(wèn)題就是：高通量測(cè)序（NGS）文庫(kù)制備時(shí)，DNA磁珠為什么可以用來(lái)純化和分選文庫(kù)？在這里我們整理相關(guān)的資料，對(duì)這個(gè)問(wèn)題做簡(jiǎn)單的闡述。分選磁珠的作用原理是基于一種固相載體可逆化固定（SPRI）的分離純化方法。磁珠體系中一般包含：磁珠、DNA、聚乙二醇（PEG）、以及鹽離子等，在一定濃度的PEG和鹽離子環(huán)境中，DNA可吸附到羧基修飾的高分子磁珠表面（即固相載體），該過(guò)程是可逆的，在適當(dāng)條件下，結(jié)合的DNA分子可以被洗脫回收。納米級(jí)別的磁珠表面性
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