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有時候,qPCR實驗會成為阻礙你課題順利開展的強勢攔路虎!看似簡單的基因表達量差異驗證,當遇到低豐富表達的基因時,也許就舉步維艱。模板獲取困難導致的RNA提取量少或RNA質量不佳,即使選用蕞佳的試劑、篩選出良好的引物,也有可能qPCR定量得到的內參基因CT值在18-20個cycle,而目的基因在31-35個循環(huán)。遇到這種情況,你是怎么解決的呢?qPCR在低豐度表達基因定量中的局限性基因的豐度是指基因在基因組中的拷貝數??煞譃楦哓S度,中等豐度和低豐度。低豐度是指目的基因在基因組中的拷貝數低,可簡單
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小翊君前幾期一直在和大家聊qPCR,今天我們開啟一個新的話題,聊一聊反轉錄。反轉錄(reversetranscription)定義:反轉錄過程簡單來說是以RNA為模板合成DNA的過程,是對中心法則的重要修正和補充。中心法則通常會出現兩個不同的表述,逆轉錄和反轉錄,二者的本質區(qū)別在于:反轉錄是在研究過程中人為提取RNA并以之為模板人工合成DNA的過程。逆轉錄是RNA病毒自主行為,以RNA為模板形成DNA的過程。前者發(fā)生在體外,后者發(fā)生在體內。反轉錄反應的示意圖如下圖所示:反轉錄實驗過程看似簡單的反
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牛血清白蛋白、免疫球蛋白G(IgG)、牛凝血酶、轉鐵蛋白、胰島素、封閉血清和低密度脂蛋白YEASEN(翊圣生物)致力于為診斷試劑公司和廣大科研用戶提供高品質的牛血清白蛋白、免疫球蛋白G(IgG)、牛凝血酶、轉鐵蛋白、胰島素、封閉血清和低密度脂蛋白,系列產品如下:(一)牛血清白蛋白(BSA)牛血清白蛋白(BovineSerumAlbumin,BSA)是牛血清中的一種球蛋白,又稱第五組分(需要注意的是,第五組分并不是BSA的一種組份,而是EdwinJ.Cohn教授早期從血液中通過特定的分離技術得到5
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熒光定量PCR實驗是分子實驗室常用的一項技術。持續(xù)關注小翊的應該都掌握了高質量cDNA的獲取方法,引物設計指南以及反應體系的配制技巧(還未get的小伙伴戳文末鏈接),然而上機時,發(fā)現和別人的反應條件不一致卻又不敢動儀器?本期小翊將帶你玩轉qPCR儀器的設置!目前市面上的qPCR儀器種類五花八門,但基本上儀器的設置都相對一致。我們以ABI7500為例進行介紹。反應板設置實驗目的選擇:我們將實驗命名為“Yeasen”,進行“Quantitation:ΔΔCt”實驗。實驗方法選擇:如選用SYBRGre
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實驗室常用到的實驗:逆轉錄實驗實驗人員通過體外模擬病毒復制過程,以提取的RNA為模板,使用逆轉錄酶催化,合成出與RNA互補的cDNA鏈。終構建cDNA文庫,并從中篩選所需的靶標基因。BUT!小伙伴們做逆轉錄實驗時,1)有沒有深究過RNA逆轉錄出的cDNA能不能真實反映出基因表達信息?2)做實驗時,有沒有發(fā)生過內參做的很好,目的基因做不出的情況?如果有發(fā)生上述情況,那么需要重新評估逆轉錄實驗結果的有效性。逆轉錄結果有效性的評定逆轉錄實驗結果有效性的評定重要的是盡可能反映樣本中原始RNA模板的信息,
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HB190313測序數據不好?是不是建庫出了問題?!——從測序數據看文庫構建高通量測序中的文庫構建指的是在DNA兩端連接特定的接頭從而使其符合測序平臺要求的過程,在高通量測序過程中,文庫質量直接影響終測序數據的質量,打個比方,如果文庫上機測序的濃度很低,樣本在FlowCell上擴增所形成的DNA樣本簇就會很少,測序數據量也將減少,這就可能導致測序失敗,所以我們說文庫的質量控制和質量評估也是NGS中的關鍵步驟。文庫如何質控?評估文庫質量的方法有哪些?n文庫質控:文庫在上機之前都有會進行質量檢測,質
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這有一份FFPE樣本建庫的檔案,還不趕緊Pick?什么是FFPE?FFPE(Formalin-FixedandParrffinEmbedded),即福爾馬林固定石蠟包埋樣本。由于這種處理方法能夠較長時間地保存組織或制備檢驗所需的組織標本,所以在臨床病理檢驗、腫瘤基因檢測中應用廣泛。在世界范圍內,大約有數十億份組織樣品保存在醫(yī)院或者組織樣品庫中,其中絕大多數是使用福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理的樣品。FFPE樣本通常代表了珍貴且來源廣泛的生物醫(yī)學研究材料,為闡明疾病機制、回顧性研究等提供了寶貴的資
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系統(tǒng)介紹鏈脲佐菌素(STZ)誘導的糖尿病疾病模型
翊圣生物提供高成功率糖尿病建模用STZ:純度≥98%(HPLC測定)。產品名稱貨號規(guī)格*(元)Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES60100mg156.00Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES76500mg386.00Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES801g676.00文章包含以下知識點1.STZ誘導糖尿病模型的構建標準SOP2.STZ誘導糖尿病模型建模效果評估指標3.STZ誘導糖尿病模型的失敗原因解析4.STZ誘導小/大鼠死亡率高的原因解析5.糖尿病建模